Anders als bei herkömmlichen Obstgeistern wird beim Zitronengeist nicht die ganze Frucht in Alkohol eingelegt und mazeriert; die Vorgehensweise beim Limoncello ist etwas komplexer. Denn um den Zitrus-Geschmack aus den Früchten zu extrahieren, dürfen nur die aromatischen Schalen ihr ätherisches Öl an den Alkohol abgeben. Das weiße Fruchtfleisch enthält zu viele Bitternoten, was den zitronig fruchtigen Geschmack verfälschen würde. Vier Wochen werden die Schalen in der Regel in neutralen Alkohol eingelegt, dann erhält Limoncello seinen typisch fruchtigen Geschmack.